Небесный Фафнир: За чертой

События разворачиваются после возвращения Соуси Минасиро домой. В центре повествования находятся юноши и девушки, чья жизнь изменилась после произошедших событий. Персонажи пытаются адаптироваться к новой реальности и осмыслить последствия случившегося.

Сюжетная линия располагается между ключевыми событиями, описанными в предыдущих частях — «Небеса и Земля» и «Исход». Показаны повседневные моменты и взаимоотношения героев в этот переходный период. Основное внимание уделяется тому, как персонажи справляются с произошедшими переменами и строят планы на будущее.